Pazu, een jonge leerling-ingenieur, vindt het meisje Sheeta zwevend in de lucht met een glimmend kristal rond haar nek. Ze ontdekken dat ze allebei op zoek zijn naar het legendarische zwevende kasteel Laputa en zijn vastberaden het mysterie van het lichtgevende kristal te ontrafelen. Op hun zoektocht botsen ze op luchtpiraten, geheime agenten en verbazingwekkende obstakels die hen van de waarheid – en van elkaar – zal scheiden.

Met een verhaal dat net zo rijk en briljant is als de schitterende animatie, bevat Castle in the Sky alle elementen die Studio Ghibli zo sterk maken.